Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG8

KCNK4, Potassium channel subfamily K member 4, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK4Q9NYG8 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
KCNK4Q9NYG8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms