Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
COMMD8Q9NX08 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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