Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PHACTR1Q9C0D0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms