Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MAP2K6-205ENST00000589647 1512 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LAIR2-201ENST00000301202 699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NLRP1Q9C000 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms