Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
NIFKQ9BYG3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms