Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY71

LRRC3, Leucine-rich repeat-containing protein 3, humanhuman

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3Q9BY71 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRRC3Q9BY71 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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