Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BRIP1Q9BX63 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BRIP1Q9BX63 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.1 ms