Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
COPS8Q99627 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
COPS8Q99627 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms