Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RPS6KC1Q96S38 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms