Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF7

GCNA, Acidic repeat-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNAQ96QF7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GCNAQ96QF7 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms