Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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SGF29Q96ES7 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SGF29Q96ES7 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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