Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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CLIP4Q8N3C7 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CLIP4Q8N3C7 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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