Protein–RNA interactions for Protein: Q658N2

WSCD1, WSC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WSCD1Q658N2 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
WSCD1Q658N2 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms