Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GEN1Q17RS7 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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GEN1Q17RS7 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GEN1Q17RS7 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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GEN1Q17RS7 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GEN1Q17RS7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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