Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
HADHQ16836 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HADHQ16836 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms