Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TRAM2Q15035 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
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