Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SMIM22-209ENST00000591870 355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CMTM5-203ENST00000359320 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC017007.3-201ENST00000479865 435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
IRF5Q13568 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
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