Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 IMMP2L-204ENST00000447215 1164 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MKRN3Q13064 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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