Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms