Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
GRIK3Q13003 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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