Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTP4A2Q12974 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTP4A2Q12974 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTP4A2Q12974 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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PTP4A2Q12974 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
PTP4A2Q12974 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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