Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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CNTN1Q12860 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CNTN1Q12860 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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