Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GABPAQ06546 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms