Protein–RNA interactions for Protein: Q05932

FPGS, Folylpolyglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FPGSQ05932 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
FPGSQ05932 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms