Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
CHRNEQ04844 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
CHRNEQ04844 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms