Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CAV1Q03135 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms