Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
TNFRSF17Q02223 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
TNFRSF17Q02223 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms