Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITX1P78337 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITX1P78337 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PITX1P78337 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms