Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HK3P52790 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HK3P52790 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HK3P52790 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HK3P52790 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HK3P52790 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HK3P52790 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HK3P52790 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms