Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDK8P49336 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDK8P49336 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms