Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ACADSBP45954 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms