Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GPD2P43304 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms