Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FDFT1P37268 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms