Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
CHRNA7P36544 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
CHRNA7P36544 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms