Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PTPRMP28827 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CR392039.1-201ENST00000623217 204 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTPRMP28827 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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