Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PSMA3P25788 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PSMA3P25788 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms