Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
FGFR3P22607 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms