Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BGNP21810 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BGNP21810 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BGNP21810 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms