Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
VAV1P15498 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms