Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ODC1P11926 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ODC1P11926 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms