Protein–RNA interactions for Protein: P0CW18

PRSS56, Serine protease 56, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRSS56P0CW18 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRSS56P0CW18 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms