Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZBED1O96006 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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