Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GJB5O95377 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GJB5O95377 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms