Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SNX4O95219 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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SNX4O95219 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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SNX4O95219 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNX4O95219 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
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