Protein–RNA interactions for Protein: O60938

KERA, Keratocan, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KERAO60938 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
KERAO60938 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KERAO60938 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KERAO60938 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KERAO60938 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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KERAO60938 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KERAO60938 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KERAO60938 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms