Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
BCKDKO14874 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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