Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HPS5Q9UPZ3 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HPS5Q9UPZ3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms