Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
KCMF1Q9P0J7 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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KCMF1Q9P0J7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
KCMF1Q9P0J7 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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