Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
THUMPD1Q9NXG2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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