Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM248Q9NWD8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms