Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
NIFKQ9BYG3 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms